中枢神经系统包括脊髓和大脑。大脑分为3个主要部分——脑干，它控制着许多基本的生命功能；大脑，它是有意识决策的中心；小脑，它参与运动和运动控制。猫的脊髓按从颈部到尾部的顺序分为与椎体相对应的区域：颈部、胸部、腰部、骶部和尾部。称为脑膜的特殊组织覆盖大脑和脊髓，脑脊液包围并保护大脑和脊髓。

在肉孢子虫病中，肌肉和其他软组织被称为肉孢子虫属原生动物的单细胞生物入侵。尽管它们的最终宿主是狗和猫等捕食者，但这些生物在各种中间宿主中形成囊肿，包括牛、猪、人类、啮齿动物、绵羊、山羊、马、野生动物和爬行动物。

　　骨骼疾病可能是发育性的、感染性的、营养性的，也可能是由骨肿瘤、创伤或未知原因引起的。当骨骼不能正常生长时，幼年动物会出现发育性骨疾病。它们可能是先天性的，也可能随着动物的生长而发生。一些更常见的原因包括遗传性品种特征和饮食不平衡。

　　肌病是主要导致肌肉或肌肉组织损伤的疾病。它们可能存在于出生时，或由于营养失衡、肌肉损伤、摄入有毒物质、癌症、代谢紊乱和炎症而发生。肌炎是一种主要在肌肉中产生炎症反应的疾病。常见的原因包括感染、寄生虫病和免疫介导的疾病。有时，原因是未知的。

　　一些关节疾病，如关节炎，会影响关节膜本身。其他类型的关节疾病会影响肌腱、软骨、囊和关节内的液体。关节疾病可能是先天性的，也可能是关节损伤、发育异常、免疫相关疾病、癌症或感染的结果。

　　骨形成缺陷称为骨营养不良。在大多数情况下，它是由钙、磷和维生素D以及调节它们的激素的缺乏或不平衡引起的，所有这些在创建和维持强壮健康的骨骼方面都很重要。

　　在子宫内感染病毒的动物可能出生时肌肉骨骼系统患病或变形。如果母亲在怀孕的某些阶段接触到某些毒素，异常也可能是先天性的。一些影响肌肉骨骼系统的遗传性疾病可能源于神经系统。

　　跛行不是一种疾病，但它可能表明肌肉骨骼系统存在疾病。肌肉骨骼疾病的症状包括虚弱、跛行、肢体肿胀和关节功能障碍。神经肌肉组织的变化可能会损害神经反应和肌肉功能。肌肉和骨骼的问题也可能影响其他器官系统，包括泌尿、消化和循环系统。

　　身体的许多系统都依赖于肌肉。猫的视觉、呼吸、排尿、繁殖，甚至咀嚼和吞咽能力都可能受到肌肉状况的影响。许多疾病可以在肌肉中表现出来，但可以追溯到神经系统。主要影响肌膜或肌纤维的疾病称为肌病。肌膜疾病可能是遗传性的或后天性的。诊断肌病通常需要实验室检查。

　　骨骼为身体提供刚性结构，保护内脏器官免受损伤。它们还容纳着骨髓，血细胞在那里形成，它们维持着身体的钙库。在称为重塑的过程中，旧骨组织不断被新骨组织替代。这有助于保持骨骼健康。

红细胞增多症是血液中红细胞数量的增加。原发性红细胞增多是一种骨髓中造血细胞发育和繁殖异常的疾病。据报道，猫身上也有这种情况。红细胞生成显著增加，刺激红细胞发育的激素水平低或正常。在继发性红细胞增多症中，红细胞生成随着促红细胞生成素水平的升高而增加。

哺乳动物血液中的白细胞或白细胞包括中性粒细胞、淋巴细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞。这些细胞在哪里产生，在血液中循环多久，以及刺激它们进入或离开通过身体组织分支的复杂微血管网络的因素方面各不相同。每种白细胞的正常数量也因物种而异。白细胞增多症是循环白细胞总数的增加；白细胞减少是一种减少。